Ders Bilgileri

Ders Bilgileri
Ders Adı Kodu Dili Türü Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS
Biyoinformatik BTZ406 Türkçe Zorunlu 8. Yarıyıl 2 + 1 3,0 2,0
Ön Koşul Dersleri
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Verilişi Yüz Yüze
Dersin Koordinatörü Dr. Öğr. Üyesi Taylan ÇAKMAK
Dersi Veren(ler)
Dersin Amacı Tarımsal Biyoteknolojide kullanılan güncel moleküler tanı ve teşhis yöntemlerinin uygulamaları ile beraber öğretilmesi
Dersin İçeriği Biyoinformatik konusunda temel bilgiler
Ders Öğrenme Kazanımları
# Öğrenme Kazanımı
1 Öğrenci, bitki ve hayvanlarda gen ekspresyonunun belirlenmesinde kullanılan moleküler teknikleri öğrenir ve uygular.
2 Öğrenci, DNA ve protein analizinde kullanılan temel laboratuvar yöntemlerini öğrenir ve uygular.
3 Öğrenci, gen ve protein düzeyinde elde edilen verileri analiz eder ve yorumlar.
4 Öğrenci, moleküler biyoloji teknikleri ile elde edilen sonuçları karşılaştırır ve değerlendirir.
5 Öğrenci, bitki ve hayvan sistemlerinde moleküler tarama yöntemlerinin kullanım alanlarını açıklar.
Ders Planı (Haftalık Konular)
Hafta Konular/Uygulamalar Yöntem
1. Hafta Çeşitli Bitki ve Hayvan Dokularından DNA İzolasyon Yöntemleri ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR). Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
2. Hafta PCR yöntemleri ve uygulama alanları Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
3. Hafta PCR sonrası moleküler tanımlama yöntemleri: RFLP, DGGE,TGGE, SSCP Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
4. Hafta DNA Dizileme yöntemleri, Sanger DNA Dizileme yöntemi, Yeni Nesil DNA Dizileme Yöntemi. Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
5. Hafta Real-Time PCR ve uygulama alanları Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
6. Hafta Mikroarray Teknolojileri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
7. Hafta Çeşitli Bitki ve Hayvan Dokularından Protein Saflaştırma Yöntemleri ve miktar tayin Yöntemleri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
8. Hafta Çeşitli Bitki ve Hayvan Dokularından Protein Saflaştırma Yöntemleri ve miktar tayin Yöntemleri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
9. Hafta Protein Elektroforez yöntemleri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
10. Hafta Western Blotlama Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
11. Hafta Protein Çipleri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
12. Hafta RİA, Elisa ve İmmünopresipitasyon Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
13. Hafta Hibridoma Teknolojileri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
14. Hafta Hibridoma Teknolojileri Görüşme, Sunum (Hazırlık), Uygulama, Anlatım
*Ara sınav ve final sınav tarihleri 14 haftalık ders işleyiş planında belirtilmemiştir. Ara sınav ve final sınav tarihleri Üniversitemiz Senatosu kararı ile akademik takvimde belirtilen tarihlerde yapılmaktadır.
Ders - Program Yeterlilikleri İlişkileri
No Program Yeterlilikleri Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Fen bilimleri ve matematik bilgilerini alanındaki çeşitli süreçleri geliştirmede kullanır.
2 Karar alma ve uygulama süreçlerinde, etik ve deontolojik ilkelere uygun davranış sergiler.
3 Bilimsel ve teknolojik gelişmeleri alanındaki uygulamalarda kullanır.
4 Temel mühendislik bilgilerini, teknik araçlarla bütünleştirerek alanındaki mühendislik problemlerini analitik yaklaşımla çözer.
5 Alanıyla ilgili tüm teknik sistemleri, sistem bileşenlerini ve üretim süreçlerini tasarlar.
6 Bitkisel ve hayvansal üretim süreçlerini bilimsel ve teknik ilkeler doğrultusunda uygular.
7 Tarım sektöründeki veri odaklı temel teknolojileri üretim süreçlerinde kullanır.
8 Sürdürülebilirlik ilke ve yaklaşımlarını tarımsal süreçlere uygular.
9 Tarıma yönelik yönetsel ve kurumsal bilgileri, küresel ve yerel gelişmeleri gözeterek kullanır.
10 Genetik, moleküler biyoloji, mikrobiyoloji ve biyokimya alanlarındaki temel bilimsel bilgileri, eleştirel bir yaklaşımla tarımsal biyoteknoloji süreçlerine entegre eder.
11 Laboratuvar ve saha uygulamalarını etkin bir şekilde kullanarak tarımsal problemlere yenilikçi ve sürdürülebilir biyoteknolojik çözümler üretir.
12 Biyolojik verileri analiz etmek için istatistiksel, matematiksel ve biyoinformatik araçları etkin bir şekilde kullanır.
13 Biyoteknolojik uygulamaların etik, yasal, fikri mülkiyet ve biyogüvenlik boyutlarına hakim olarak, mesleki ve sosyal sorumluluklarını yerine getirir.
14 Disiplinler arası projelerde etkin bir şekilde çalışarak elde ettiği proje bulgularını etkili sunum teknikleriyle paylaşır.
15 Alanındaki bilimsel ve teknolojik gelişmeleri sürekli takip ederek yaşam boyu öğrenme ve girişimcilik becerilerini yenilikçi fikirler üreterek sergiler.
Dersin Öğrenme Kazanımlarının Program Yeterlilikleri İle İlişkisi
Program Yeterlilik DK1 DK2 DK3 DK4 DK5
PY1 5 5 5 5 5
PY2 4 4 4 4 4
PY3 5 5 5 5 5
PY4 3 3 3 3 3
PY5 4 4 4 4 4
PY6 3 3 3 3 3
PY7 4 4 4 4 4
PY8 4 4 4 4 4
PY9 1 1 1 1 1
PY10 5 5 5 5 5
PY11 1 1 1 1 1
PY12 1 1 1 1 1
PY13 1 1 1 1 1
PY14 1 1 1 1 1
PY15 1 1 1 1 1
Kaynaklar
Ders Kitabı veya Notu Ders Kitabı veya Ders Notu bulunmamaktadır.
Diğer Kaynaklar
  • Temizkan G, Arda N 2008, Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, Nobel Tıp Kitapevi, İSTANBUL
  • Guimarães EP, Ruane J, Scherf BD, Sonnino A, Dargie JD 2007 Marker-Assisted Selection. Current Status and Future Perspectives in Crops, Livestock, Forestry and Fish. FAO: Rome, ISBN 978-92-5- 105717-9
  • Hawley, R.S. And Walker, M.Y. (2003). Advanced Genetic Analysis. Finding Meaning in a Genome. Blackwell Publishing. Victoria/Australia
  • Bartlett JMS, Stirling D (2002).: Methods in molecular Biology-PCR Protocols. Humana Press Newyork /USA
  • Bustin SA 2010.: The PCR Revolution- Basic Technologies and Applications. Cambridge University Press, Cambridge, England.
AKTS / İş Yükü Tablosu
AKTS / İş Yükü Tablosu Sayısı Süresi (Saat) Toplam İş Yükü (Saat)
Ders İçi
Ders Saati (14 Hafta) 14 2 28
Ders Dışı
Araştırma 14 1 14
Diğer Faaliyetler 2 3,5 7
Sınavlar
Ara Sınav 1 1 1
Final 1 1 1
Toplam İş Yükü 51
*AKTS = (Toplam İş Yükü) / 25,5 Dersin AKTS Kredisi 2,0