Ders Bilgileri

Ders Bilgileri
Ders Adı Kodu Dili Türü Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS
Moleküler Modelleme FIZ 636 Türkçe Zorunlu 3 + 0 3,0 8,0
Ön Koşul Dersleri
Dersin Seviyesi Lisansüstü
Dersin Verilişi Anlatım
Dersin Koordinatörü Doç. Dr. Songül TARAN
Dersi Veren(ler)
Dersin Amacı Moleküler modellemede kullanılan metotların ve teorik uygulamalara ait temel kavramların öğrenilmesi
Dersin İçeriği Moleküler modellemede temel kavramlar, Yarı-deneysel metodlar, Potansiyel enerji fonksiyonları, Geometri optimizasyonu, Optimizasyon algoritmaları, Monte Carlo simülasyon metodları, Mikrokanonik topluluk Monte Carlo metodları,Kanonik topluluk Monte Carlo simülasyon metodları,İzotermal ve izobarik Monte Carlo simülasyon metodları, Moleküler dinamik simülasyon metodları,Mikrokanonik moleküler dinamik simülasyonları, Kanonik moleküler dinamik simülasyonları, İzotermal ve izobarik moleküler dinamik simülasyon metodları
Ders Öğrenme Kazanımları
# Öğrenme Kazanımı
1 Moleküler modellemede yaygın olarak kullanılan teknikleri kullanarak fiziksel büyüklüklerin hesabı hakkında bilgi sahibi olunur.
Ders Planı (Haftalık Konular)
Hafta Konular/Uygulamalar Yöntem
1. Hafta Moleküler modellemede temel kavramlar Görüşme
2. Hafta Yarı-deneysel metodlar Görüşme
3. Hafta Potansiyel enerji fonksiyonları Görüşme
4. Hafta Geometri optimizasyonu Görüşme
5. Hafta Optimizasyon algoritmaları Görüşme
6. Hafta Monte Carlo simülasyon metodları Görüşme
7. Hafta Mikrokanonik topluluk Monte Carlo metodları Görüşme
8. Hafta Kanonik topluluk Monte Carlo simülasyon metodları Görüşme
9. Hafta Kanonik topluluk Monte Carlo simülasyon metodları Görüşme
10. Hafta İzotermal ve izobarik Monte Carlo simülasyon metodları Görüşme
11. Hafta Moleküler dinamik simülasyon metodları Görüşme
12. Hafta Mikrokanonik moleküler dinamik simülasyonları Görüşme
13. Hafta Kanonik moleküler dinamik simülasyonları Görüşme
14. Hafta İzotermal ve izobarik moleküler dinamik simülasyon metodları Görüşme
*Ara sınav ve final sınav tarihleri 14 haftalık ders işleyiş planında belirtilmemiştir. Ara sınav ve final sınav tarihleri Üniversitemiz Senatosu kararı ile akademik takvimde belirtilen tarihlerde yapılmaktadır.
Ders - Program Yeterlilikleri İlişkileri
No Program Yeterlilikleri Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Lisans eğitiminde edinilen Klasik, Modern ve Kuantum Fiziğinin teorik ve deneysel uygulamalarının temellerini ileri düzeyde arttırmak.
2 İleri seviyede karşılaşılan fizik problemlerinin fiziksel prensiplere uygun olarak yorumlayabilme ve bu problemleri çözme yeteneğini geliştirmek.
3 Fizikle ilgili teori ve uygulamalar arasında bağlantı kurma yeteneğini edinmek.
4 Fizik literatürünü takip etme, yorumlama ve bu edinimleri kullanarak ileri düzey yayın hazırlayabilme becerisini kazanmak.
5 Lisansüstü eğitimi sırasında derslerden edindiği kazanımlarla belirli bir topluluk önünde sunum yapabilme yeteneği kazanmak.
6 Farklı disiplinlerin yaklaşım ve bilgilerini fizikte yeni kuramlar üretebilecek düzeyde kullanabilmek.
7 Deneysel veya teorik fizikte bilinmeyen sorularla ilgili bilgileri toplama, karşılaştırma, analiz etme ve çözüm üretme becerisi kazanmak.
8 Lisansüstü eğitim süresince katılınan çalıştay, seminer ve konferans gibi bilimsel etkinliklerde, benzer konularda çalışan meslektaşları ile iletişim kurarak her geçen gün gelişen Fizik literatürünü takip etme ve kullanabilme yeteneğini edinmek.
9 Lisansüstü eğitim süresince edinilen ileri düzey bilgi birikimleri ile teorik model kurabilme, modelle ilgili problemleri çözebilme, ilgili modele deneysel yaklaşabilme ve deney yoluyla elde edilen verilerin analizini yaparak yorumlayabilmek.
10 İleri aşamadaki akademik hayatta kullanılacak tüm bilgilerin temellerinin oluşturulmasını sağlamak ve tüm bu bilgiler arasındaki ilişkilerin kurularak fizik alanında ileri düzey araştırmalar yapabilecek seviyelere ulaşmak.
Dersin Öğrenme Kazanımlarının Program Yeterlilikleri İle İlişkisi
Program Yeterlilik DK1
PY1 5
PY2 4
PY3 5
PY4 5
PY5 4
PY6 4
PY7 4
PY8 4
PY9 5
PY10 4
Kaynaklar
Ders Kitabı veya Notu Ders Kitabı veya Ders Notu bulunmamaktadır.
Diğer Kaynaklar
  • R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications
  • D.Frankel and B.Smit, Understanding Molecular Simulation
AKTS / İş Yükü Tablosu
AKTS / İş Yükü Tablosu Sayısı Süresi (Saat) Toplam İş Yükü (Saat)
Ders İçi
Ders Saati (14 Hafta) 14 3 42
Ders Dışı
Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları 14 3 42
Araştırma 14 3 42
Görüşme 14 1 14
Sunum (Hazırlık) 14 1 14
Sınavlar
Ara Sınav 1 1 2 2
Ödev 1 1 4 4
Final 1 2 2
Sınıf İçi Etkinlik 14 3 42
Toplam İş Yükü 204
*AKTS = (Toplam İş Yükü) / 25,5 Dersin AKTS Kredisi 8,0