Ders Bilgileri

Ders Bilgileri
Ders Adı Kodu Dili Türü Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS
Biyoenformatik BMM339 Türkçe Zorunlu 5. Yarıyıl 3 + 0 3,0 3,0
Ön Koşul Dersleri
Dersin Seviyesi Lisans
Dersin Verilişi Yüz yüze
Dersin Koordinatörü
Dersi Veren(ler)
Dersin Amacı Biyoloji veri bankalarından gelen bilginin anlaşılır ve organize hale getirilmesi için kullanılan tekniklerin anlaşılmasının sağlanması amaçlanmaktadır.
Dersin İçeriği Biyoinformatik kavramı ve kullanım alanları, bilgi kuramı, bilginin toplanması, işlenmesi ve paylaşılması, veri bankası oluşturma ve kullanımı, protein ve nükleotid veri tabanlarının incelenmesi, primer dizaynı, nükleotid ve protein dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesi.
Ders Öğrenme Kazanımları
# Öğrenme Kazanımı
1 Öğrenciler biyoinformatik kullanım alanlarını öğrenirler.
1 Biyoakışkan Sistemlere Giriş
1 Öğrenciler biyoinformatik kullanım alanlarını öğrenirler.
2 Öğrenciler bilginin toplanması ve işlenmesi konusunu anlamış olurlar.
2 Biyoakışkanların temel prensiplerini öğrenir ve kavrar.
2 Öğrenciler bilginin toplanması ve işlenmesi konusunu anlamış olurlar.
3 Öğrenciler biyolojik veri bankalarını kullanabilirler.
3 Momentum Aktarımında Temel Prensipler ve Newton’un Momentum Yasası
3 Öğrenciler biyolojik veri bankalarını kullanabilirler.
4 Öğrenciler dizi analizi sonuçlarını değerlendirebilirler.
4 Akışkanlar Dinamiği ve statiği hakkında bilgi sahibi olma
4 Öğrenciler dizi analizi sonuçlarını değerlendirebilirler.
5 Bernoulli ilkesini kavramak ve bir akışkanlarda uygulamak
Ders Planı (Haftalık Konular)
Hafta Konular/Uygulamalar Yöntem
1. Hafta Biyoinformatik Kavramı
1. Hafta Biyoakışkanlar Mekaniğine Giriş Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları
1. Hafta Biyoinformatik Kavramı
2. Hafta Biyoinformatik kullanım alanları
2. Hafta Akışkan Statiği Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları
2. Hafta Biyoinformatik kullanım alanları
3. Hafta Bilgi kuramı
3. Hafta Akışkan Kinematiği-1 Diğer Faaliyetler
3. Hafta Bilgi kuramı
4. Hafta Bilginin toplanması ve işlenmesi
4. Hafta Akışkan Kinematiği-2 Uygulama
4. Hafta Bilginin toplanması ve işlenmesi
5. Hafta Bilginin toplanması ve işlenmesi
5. Hafta Akışkanların Sınıflandırılması Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları, Diğer Faaliyetler
5. Hafta Bilginin toplanması ve işlenmesi
6. Hafta Bilginin paylaşılması
6. Hafta Kan Dolaşımı Diğer Faaliyetler
6. Hafta Bilginin paylaşılması
7. Hafta Veri bankaları oluşturma ve veri bankalarının kullanımı
7. Hafta Kütle, Bernoulli ve Enerji Denklemleri 1 Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları, Diğer Faaliyetler
7. Hafta Veri bankaları oluşturma ve veri bankalarının kullanımı
8. Hafta Arasınav
8. Hafta Kütle, Bernoulli ve Enerji Denklemleri-2 Uygulama
8. Hafta Arasınav
9. Hafta Nukleik asit ve protein biyokimyası
9. Hafta Vize Sınavı ve soruların tartışılması Diğer Faaliyetler
9. Hafta Nukleik asit ve protein biyokimyası
10. Hafta Nukleik asit ve protein biyokimyası
10. Hafta Kardiyovasküler Sistem , Kan Dolaşımı ve akış miktarı akımın sürekliliği kanunu. Uygulama
10. Hafta Nukleik asit ve protein biyokimyası
11. Hafta Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesi
11. Hafta Laplace yasası ve Kan akışı, ölüçümü Uygulama
11. Hafta Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesi
12. Hafta Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesi
12. Hafta Kan ve biyo-malzemelere karşı vücudun tepkisi Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları
12. Hafta Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesi
13. Hafta Primer dizaynı
13. Hafta Biyo akışkanlarla ilgili Bernolli ve diğer akışkan formülleri ile uygulama Uygulama
13. Hafta Primer dizaynı
14. Hafta Nukleotid dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesi
14. Hafta Biyo akışkanlarla ilgili uygulamalar Uygulama
14. Hafta Nukleotid dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesi
*Ara sınav ve final sınav tarihleri 14 haftalık ders işleyiş planında belirtilmemiştir. Ara sınav ve final sınav tarihleri Üniversitemiz Senatosu kararı ile akademik takvimde belirtilen tarihlerde yapılmaktadır.
Ders - Program Yeterlilikleri İlişkileri
No Program Yeterlilikleri Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Alanla ilgili teori ve ilkeleri açıklar.
2 Sağlık bilimleri ve mühendislik bilgilerini kullandırarak Biyomedikal Mühendisliği alanında uygulama becerisi kazandırır.
3 Sağlık alanında kullanılan bir tıbbi cihaz, yazılım ya da ürünün tümünü veya bir bileşenini, gerçekçi koşullar altında tasarlama ve geliştirme becerisi kazandırır.
4 Tıpta görülen bir problemi mühendislik yaklaşımları ile tanımlama, modelleme ve çözme becerisi kazandırır.
8 Sözlü ve yazılı iletişim kurma becerisi kazanmak. Yabancı bir dili meslekî yaşamda etkin biçimde kullandırır
Dersin Öğrenme Kazanımlarının Program Yeterlilikleri İle İlişkisi
Program Yeterlilik DK1 DK2 DK3 DK4 DK5 DK6 DK7 DK8 DK9
PY1 5 5 5 5 5 5 5 5 5
PY2 4 4 4 4 4 4 4 4 4
PY3 5 5 5 5 5 5 5 5 5
PY4 4 4 4 4 4 4 4 4 4
PY8 5 5 5 5 5 5 5 5 5
Kaynaklar
Ders Kitabı veya Notu Ders Kitabı veya Ders Notu bulunmamaktadır.
Diğer Kaynaklar
  • Introduction to Bioinformatics, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, New York, 2002.
  • Bioinformatics : A Practical Approach, Shui Qing Ye, Chapman and Hall/CRC, London, 2007.
  • Lee Waite, Jerry Fine, Applied Biofluid Mechanics, 1st Edition, McGraw-Hill, 2007. Yunus A. Çengel, John M. Cimbala, Akışkanlar Mekaniği-Temelleri ve Uygulamaları, Güven Bilimsel, Birinci Baskıdan Çeviri, 2008.
  • David A. Rubenstein, Wei Yin ve Mary D. Frame Biyomedikal Mühendisliği alanında bir cilt • 2016
  • Ders Notları
  • Introduction to Bioinformatics, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, New York, 2002.
  • Bioinformatics : A Practical Approach, Shui Qing Ye, Chapman and Hall/CRC, London, 2007.
AKTS / İş Yükü Tablosu
AKTS / İş Yükü Tablosu Sayısı Süresi (Saat) Toplam İş Yükü (Saat)
Ders İçi
Ders Saati (14 Hafta) 14 3 42
Sınavlar
Ara Sınav 1 30 30
Final 1 30 30
Toplam İş Yükü 102
*AKTS = (Toplam İş Yükü) / 25,5 Dersin AKTS Kredisi 3,0