| Ders Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| Moleküler Modelleme | FIZ 636 | 3 + 0 | 3,0 | 8,0 |
| Ön Koşullar | Yok |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Lisansüstü |
| Dersin Türü | Ders |
| Dersin Verilişi | Anlatım |
| Dersin Koordinatörü |
Doç. Dr. Songül TARAN |
| Dersi Verenler | |
| Dersin Yardımcıları | |
| Dersin Amacı | Moleküler modellemede kullanılan metotların ve teorik uygulamalara ait temel kavramların öğrenilmesi |
| Dersin İçeriği | Moleküler modellemede temel kavramlar, Yarı-deneysel metodlar, Potansiyel enerji fonksiyonları, Geometri optimizasyonu, Optimizasyon algoritmaları, Monte Carlo simülasyon metodları, Mikrokanonik topluluk Monte Carlo metodları,Kanonik topluluk Monte Carlo simülasyon metodları,İzotermal ve izobarik Monte Carlo simülasyon metodları, Moleküler dinamik simülasyon metodları,Mikrokanonik moleküler dinamik simülasyonları, Kanonik moleküler dinamik simülasyonları, İzotermal ve izobarik moleküler dinamik simülasyon metodları |
| Ders Öğrenme Kazanımları |
- Moleküler modellemede yaygın olarak kullanılan teknikleri kullanarak fiziksel büyüklüklerin hesabı hakkında bilgi sahibi olunur. |
| Hafta | Konular | Öğretim Yöntemleri |
|---|---|---|
| 1. Hafta | Moleküler modellemede temel kavramlar | Sözel Anlatım |
| 2. Hafta | Yarı-deneysel metodlar | Sözel Anlatım |
| 3. Hafta | Potansiyel enerji fonksiyonları | Sözel Anlatım |
| 4. Hafta | Geometri optimizasyonu | Sözel Anlatım |
| 5. Hafta | Optimizasyon algoritmaları | Sözel Anlatım |
| 6. Hafta | Monte Carlo simülasyon metodları | Sözel Anlatım |
| 7. Hafta | Mikrokanonik topluluk Monte Carlo metodları | Sözel Anlatım |
| 8. Hafta | ARA SINAV | |
| 9. Hafta | Kanonik topluluk Monte Carlo simülasyon metodları | Sözel Anlatım |
| 10. Hafta | İzotermal ve izobarik Monte Carlo simülasyon metodları | Sözel Anlatım |
| 11. Hafta | Moleküler dinamik simülasyon metodları | Sözel Anlatım |
| 12. Hafta | Mikrokanonik moleküler dinamik simülasyonları | Sözel Anlatım |
| 13. Hafta | Kanonik moleküler dinamik simülasyonları | Sözel Anlatım |
| 14. Hafta | İzotermal ve izobarik moleküler dinamik simülasyon metodları | Sözel Anlatım |
| R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications |
| D.Frankel and B.Smit, Understanding Molecular Simulation |
| Program Yeterlilik | Katkı Düzeyi | DK1 | Ölçme Yöntemi |
|---|---|---|---|
| PY1 | 5 | 5 | 40,60 |
| PY2 | 4 | 4 | 40,60 |
| PY3 | 5 | 5 | 40,60 |
| PY4 | 5 | 5 | 40,60 |
| PY5 | 4 | 4 | 40,60 |
| PY6 | 4 | 4 | 40,60 |
| PY7 | 4 | 4 | 40,60 |
| PY8 | 4 | 4 | 40,60 |
| PY9 | 5 | 5 | 40,60 |
| PY10 | 4 | 4 | 40,60 |
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ders Katkı Düzeyi | Yok | Çok Düşük | Düşük | Orta | Yüksek | Çok Yüksek |
| Ölçme Yöntemi | Yazılı sınav | Sözlü sınav | Ödev/Proje | Laboratuvar Çalışması | Sunum /Seminer |
| Etkinlik | Sayısı | Süresi (Saat) | Toplam İş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 3 | 42 |
| Ön Hazırlık, Pekiştirme Çalışmaları | 14 | 3 | 42 |
| Araştırma | 14 | 3 | 42 |
| Sözel Anlatım | 14 | 1 | 14 |
| Görsel Sunum | 14 | 1 | 14 |
| Ara Sınav 1 | 1 | 2 | 2 |
| Ödev 1 | 1 | 4 | 4 |
| Final | 1 | 2 | 2 |
| Sınıf İçi Etkinlik | 14 | 3 | 42 |
| Toplam İş Yükü | 204 | ||
| Dersin AKTS Kredisi | 8,0 | ||
